1、血清蛋白電泳
新鮮血清經電泳后可地描繪出患者蛋白質的全貌，有助于許多臨床疾病判斷的參考，在各類教材書上已清晰的描述了各種病理現象所顯現的圖像，一般常見的是白蛋白降低，某個球蛋白區域升高，提示不同的臨床意義。如球蛋白多克隆(poly-clonal)增高，β-γ融合的橋連現象，在γ區呈現細而密的寡克隆(oligoclonal)區帶，及由單一克隆漿細胞異常增殖所產生的單克隆(monoclonal)免疫球蛋白區帶，又稱M蛋白(Monoclonal Protein)帶，血清蛋白電泳是其實驗診斷方法。
血清蛋白電泳目前常用的檢查方法是醋酸纖維膜電泳法。
2、免疫固定電泳
血清免疫固定電泳(Immunofixation, IF)技術是血清蛋白質在瓊脂糖凝膠介質上經電泳分離后，應用蛋白質固定劑和各型免疫球蛋白及其輕鏈抗血清，加于凝膠表面的泳道上，經孵育和擴散后，若有對應的抗原存在，則在適應位置形成抗原抗體復合物并沉淀下來。染色后蛋白質電泳參考泳道和抗原抗體沉淀區帶被氨基黑著色，根據電泳移動距離分離出單克隆組份，可對各類免疫球蛋白及其輕鏈進行分型。血清免疫固定電泳技術用于M蛋白的型、亞型和輕鏈型，本周(Bence-Jonse)蛋白和游離輕鏈的分型和鑒別。
3、同工酶電泳
血清乳酸脫氫酶同工酶電泳
血清肌酸激酶及其亞型同工酶電泳
血清堿性磷酸酶同工酶電泳
血清堿性磷酸酶同工酶電泳具有三種不同結構的基因編碼或在轉移后修飾的結果，按其氨基酸序列可分為小腸型、胎盤型和組織非特異型(肝、腎、骨)，它們各自表達產物可在血清中呈現，具有不同的意義。利用麥胚凝集素(wheat germ agglutinin, WGA)與ALP-L1和ALP-B糖鏈親和力的不同，血清與WGA作用再經電泳后可將ALP同工酶予以分離。肝外膽道阻塞轉移肝癌時，高分子ALP(ALP-L2)明顯增高，在原發性肝癌時肝型ALP(ALP-L1)明顯增高，骨轉移性癌時ALP-B增高。
4、脂蛋白電泳
應用自動電泳系統可將血清中脂蛋白組份進行分離，呈現LDL、VLDL和HDL條帶，輸入TC值，計算各種脂蛋白中膽固醇含量，LDL-C/HDL-C比值在正常人群組與冠心病患者組存在顯著差異(p<0.001);診斷臨界值(cut-off point)為3.89，診斷靈敏度76.7%，特異性79.8%。LDL-C/HDL-C比值是粥樣硬化性冠脈疾病重要的危險因子之一，明顯優于膽固醇或其它血脂的單個含量指標，且隨比值的增加，患冠脈疾病的危險性相應增大。
在凝膠中脂蛋白的等電點不同，不僅可區分α,前β和β區帶，又因介質中含有抗LP(a)抗體及陽離子存在，抗LP(a)抗體與患者血清中LP(a)結合形成復合物，陽離子則抑制其它脂蛋白的泳動速度，LP(a)便與其它脂蛋白分離開來。清晰的LP(a)條帶呈現在前β與γ區域之間，陽性條帶掃描后，可獲得區帶的面積及其百分含量，提高了對心、腦血管獨立的危險因子LP(a)檢測的敏感性和特異性。
5、血紅蛋白電泳
血紅蛋白電泳可使正常血紅蛋白HbA與HbA2分離，也可檢測出大部分異常血紅蛋白如:HbS、HbD、HbC和HbE。當HbA2、HbC和HbE>20%時，則難以分離和鑒別。應先用堿性瓊脂糖凝膠血紅蛋白電泳進行正常和異常血紅蛋白的分離和檢測，通常用于孕婦的篩選，然后再進行酸性瓊脂糖凝膠血紅蛋白電泳，對異常血紅蛋白予以分離和鑒別。
血紅蛋白遺傳性分子病常分為異常Hb病和地中海貧血兩大類。異常Hb病如鐮狀細胞貧血，在堿性緩沖液中異常HbS電泳區帶的位置呈現在HbA與HbA2之間，異常血紅蛋白的HbC和HbE電泳遷移率都十分緩慢，HbC和HbA2可重疊。在PH6.2的枸櫞酸緩沖液的是瓊脂糖介質電泳中，由于HbC不能與HbA分離，這樣就可檢測出HbE。異常血紅蛋白HbD是在堿性緩沖液中其電泳遷移率如同HbS，而在PH6.2枸櫞酸緩沖液的瓊脂糖介質中，因HbS與HbA不能分離，這樣就可以分離和檢測出HbD。β-地中海貧血是HbA的合成受損，電泳圖譜可呈現HbA2與HbF區帶。
